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综合新闻

孙立莹、修乐山、张驰等在《Microbial Biotechnology》发表新冠病毒检测与分型方法

发布日期:2022-03-03 字号:

由新冠病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情对全球公共卫生、社会稳定、经济发展造成了前所未有的威胁。截止目前,全球累计确诊病例已突破4亿,死亡人数超过500万。在严峻的疫情形势下,面对新冠病毒的频繁变异,对新冠病毒进行识别与分型,有助于病毒快速溯源和疫情精准防控。

在普遍依赖于高通量测序技术的情况下,开发操作简便、经济高效的新冠病毒检测及其变异株鉴别的方法,可以在患者出现临床症状的早期对新冠病毒进行快速检测与分型,为疫情精准防控提供新手段。彭俊平课题组与任丽丽课题组合作,基于高分辨率熔解曲线(high-resolution meltingHRM)技术平台,建立了一种用于新冠病毒检测及其变异株鉴别的快速、灵敏、低成本的方法。本方法纳入了针对新冠病毒检测的3个目标基因及其变异株鉴别的12个突变位点,同时设置RNase P作为内参基因,整个检测流程仅需要2小时,即可实现新冠病毒的检测及其变异株的鉴别。研究中,使用290例新冠病毒阳性临床样本对新方法的临床应用效果进行了评估,与Sanger测序及纳米孔测序的比较结果显示,新冠病毒检测与变异株鉴别的一致性分别为100%95.1%。使用31种呼吸道常见病原体对本方法的特异度进行评估,结果显示均无交叉反应,且所有靶标的最低检出限均低于10拷贝/反应。此外,本方法具有较好的灵活性,随着新冠病毒不同变异株的出现,可以根据实际需要纳入新增突变位点,为疫情防控和流行病学监测提供了候选手段。

本研究得到中国医学科学院医学与健康科技创新工程,中央高校基本科研业务费和国家科技资源共享服务平台课题的资助。